Odeljenje za kliničku bakteriologiju, mikologiju i parazitologiju- Odeljenje 130
Na Odeljenju kliničke bakteriologije, mikologije i parazitologije zaposlena su tri istraživača u naučnom zvanju. Istraživači učestvuju u naučno istrživačkom radu i obavljaju stručno specijalističke poslove iz oblasti zdravstvene zaštite domaćih životinja.
Akreditovano je 6 metoda ispitivanja:
- Ispitivanje osetljivosti ENTEROBACTERIACEAE na antibiotike, metodom disk difuzije;
- Utvrđivanje uzročnika salmoneloze (Salmonella spr).
- Utvrđivanje uzročnika varoze pčela (Varroa destructor).
- Određivanje ukupnog broja aerobnih mikroorganizama u semenu životinja.
- Bakteriološko ispitivanje farmaceutskih proizvoda – provera sterilnosti.
- Mikrobiološka ćistoća lekova za koje se ne zahteva da budu u skladu sa testom na sterilost.
Laboratorijska ispitivanja obuhvataju izolaciju i identifikaciju bakterija, gljivica i plesni, dijagnostiku ekto i endoparazitoza kod životinja. Ispitivanja se izvode na biološkim materijalima od živih ili uginulih domaćih životinja, kućnih ljubimaca, laboratorijskih životinja, pčela i riba. Materijal za ispitivanja su i nazuvci, prostirka, pelene, brisevi površina (radne površine, brisevi objekata za uzgoj životinja i transportnih sredstava), voda (iz vododvoda i voda za napajanje životinja), pčelinje saće i drugo.
Na Odeljenju se izvode sledeće molekularne metode spitivanja:
1 | Izolacija DNK (Stoll kit) | Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Lawsonia intracellularis |
2 | Multipleks PCR | Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Lawsonia intracellularis |
3 | Izolacija DNK (Stool Kit) | E. acervulina, E. brunetti, E. maxima, E. mitis, E. necatrix, E. praecox, E. tenella |
4 | Detekcija metodom PCR | E. acervulina, E. brunetti, E. maxima, E. mitis, E. necatrix, E. praecox, E. tenella |
5 | Izolacija DNK (pčele) | Nosema apis i Nosema ceranae |
6 | Detekcija metodom PCR (pčele) | Nosema apis i Nosema ceranae |
7 | Rezistotipizacija | Ampicilin, Amoksicilin/ klavulonska kiselina, Hloramfenikol, Ciprofloksacin, Gentamicin, Nalidiksinska kiselina, Streptomicin, Sulfonamidi, Tetraciklin, Trimetoprim/sulfametoksazol, Trimetoprim, Cefopodiksim, Cefotaksim, Ceftazidim |
8 | Utvrđivanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) mikrodilucionom ili agardilucionom metodom | Ampicilin, Amoksicilin/ klavulonska kiselina, Hloramfenikol, Ciprofloksacin, Gentamicin, Nalidiksinska kiselina, Streptomicin, Sulfonamidi, Tetraciklin, Trimetoprim/sulfametoksazol, Trimetoprim, Cefotaksim, Ceftazidim |
9 | Fentipsko utvrđivanje ESBL produkujućih bakterija ( CLSI 2015, dokument broj M100-S25) | Cefokisitin, Cefepime, Meropenem |
10 | Utvrđivanje sinergističke reakcije antibiotika sa i bez klavulonske kiseline (potvrda ESBL perodukujućih bakterija) | Cefotaksim, Ceftazidim sa i bez klavulonske kiseline |
11 | Utvrđivanje filogenetske pripadnosti izolata E. coli PCR metodom | Escherichia coli |
12 | Izolacija DNK za RAPD metodu | Qiagen kit za tkivo |
13 | Utvrđivanje genetičkog diverziteta S. Enteritidis PCR metodom | Random amplified polymorphic DNA-RAPD metoda |
14 | Izolacija DNKA bakterija | Metoda kuvanja |
15 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na hloramfenikol metodom PCR | Cat1, cat2, cat3, cmlA, floR |
16 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na trimetoprim metodom PCR | drfA1, dfrA5/dfrA14, dfrA7/dfrA17, dfrA12, dfrB1/B2, |
17 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na streptomicin metodom PCR | strA, strB , aadA1, aadA2 |
18 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na sulfonamide metodom PCR | sul1, sul2, sul3 |
19 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na teracikline metodom PCR | tetA, tetB, tetC, tetD, tetE, tetG, tetH, tetM, tetO |
20 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na gentamicin metodom PCR | aac(3)-I, aac(3)-II, aac(3)-III, aac(3)-IV, ant(2)-I, armA |
21 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na prošireni spektar beta-laktama metodom PCR | blaTEM, blaCTX-M, blaSHV, blaOXA-1, blaOXA-2, blaAmpC, blaCMY |
22 | Detekcija gena koji kodiraju rezistenciju na hinolone koja se prenosi preko plazmida (PMQR) | qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS, aac61-lb-cr, qepA, oqxA, oqxB |
23 | PCR za umnožavanje QRDR kod salmonella (pre sekvenciranja) | gyrA, gyrB, parC, parE |
24 | PCR za umnožavanje QRDR kod E.coli (pre sekvenciranja) | gyrA, gyrB, parC, parE |
25 | PCR metoda za utvrđivanje mobilnih genetičkih elemenata integrona i enzima integraza, detekcija gena pre sekvenciranja | Int1, int2, 5’3’, Hep74/Hep51 |
26 | Prečišćavanje PCR produkata za sekvenciranje | Komercijalni kit |
27 | Utvrđivanje uloge efluks pumpe u rezistenciji na antibiotike | MIC sa ciljnim antibiotikom i MIC sa ciljnim antibiotikom i efluks inhibitorom (Phe-Arg-β-Naphtylamide (PAβN) |
28 | Utvrđivanje pojave konjugabilnih plazmida kod izolata bakterija | Konjugacija sa recipijentom E. coli H225 (rezistentan na rifapicin) |
29 | Izolacija plazmida | Metoda po Birnboim/Doly, Alkalna liza |
30 | Poređenje nuklotidnih i proteinskih sekvenci | BioEdit i Blast programi |
Reference:
- Velhner M., Kozoderović G., Grego E., Galić N., Stojanov I., Jelesić Z., Kehrenberg C.: Clonal Spread of Salmonella enterica Serovar Infantis in Serbia: Acquisition of Mutations in the Topoisomerase Genes gyrA and parC Leads to Increased Resistance to Fluoroquinolones. Zoonoses and Public Health, ISSN 1863-1959, 60, 8, 1-7, 2013 doi:10-1111/zph 12081, M21 8,0
- Kozoderović G., Velhner M., Jelesić Z., Golić N., Lozo J., Kehrenberg C.: Prevalence of quinolone resistance and mutations in the topoisomerase genes in Salmonella enterica serotype Enteritidis isolates from Serbia. International Journal of Antimicrobial Agents, ISSN 0924-8579, 40, str.455-457, 2012, M21 8,0
- Todorović D., Velhner M., Grego E., Vidanović D., Milanov D., Krnjaić D., Kehrenberg C.: Molecular characterization of multidrug-resistant Escherichia coli isolates from bovine clinical mastitis and oigs in the Vojovodina province Serbia. Microbial Drug Resistance, doi: 10.1089/mdr.2017.0016
- Velhner M: Mechanisms of resistance to quinolones and epidemiological significance of Salmonella Acta Veterinaria, 66:147-159, 2016.
- Kureljušić JM, Dmitirić MP, Vidanović DS, Teodorović VB, Kureljušić BI, Velhner MJ, Karabasil NR: Prevalence of Salmonella enteric in slaughter pigs in Serbia: Serotyping, PFGE-genotyping and antimicrobial resistance. The journal of Infection in Developing Countries, 11:640-645, 2017.
- Milanov D., Ljubojević D., Čabarkapa I., Karabasil N, Velhner M: Biofilm as risk factor for Salmonella contamination in various stages of poultry production. European Poultry Science, DOI: 10.1399/eps.2017.190
- Milanov D., Ljubojević D., Čabarkapa I., Karabasil N, Velhner M: Biofilm as risk factor for Salmonella contamination in various stages of poultry production. European Poultry Science, DOI: 10.1399/eps.2017.190
- Kozoderović G., Velhner M., Jelesić Z., Stojanov I., Petrović T., Stojanović D., Golić N.: Molecular typing and antimicrobial resistance of Salmonella Enteritidis isolated from poultry, food, and humans in Serbia. Folia Microbiologica, ISSN 0015-5632, 56, 3, Str.66-71, 2011, M23 3,0
- Velhner M., Stojanović D.: Mutational Polymorphism in the Bacterial Topoisomerase Genes Driven by Treatment with Quinolones. Point Mutation, Edited by Colin Logie, Rijeka, Intech, 2012, Str.185-210, ISBN 979-953-307-447-3, M14 4,0
- Velhner M., Potkonjak D., Stojanović D., Mitevski D., Stojanov I., Petrović J.: Rezistencija salmonela na antibakterijske lekove i mere kontrole u živinarskoj proizvodnji. Veterinarski glasnik, ISSN 0350-2457, 67, 1-2, str.87-96, 2013, M51 2,0
- Velhner M., Kozederović G., Kovačević M., Suvajdžić L., Košarčić S., Petrović J., Stojanović D.: Resistance to beta lactam antibiotics in gram-negative microorganisms, a brief review. Savremena poljoprivreda, ISSN 0350-1205, 62, 3-4, str., 2013, M51 2,0
- Kozoderović G., Jelesić Z., Velhner M.: Resistance to quinolones among Salmonella enteretidis isolates in Vojvodina. Microbiologia Balkanica 2009, Book of abstracts and Programme, 6th Balkan Congress of Microbiology, Ohrid, 28-31.Oktober, Makedonija, Skopje, Macedonian Medical Association, 2009, Str.120, M34 0,5
- Velhner M., Suvajdžić Lj., Petrović J., Šeperanda M.: Antimicrobial resistance of Escherichia coli in wild animals. Arhiv veterinarske medicine, 5: 35-44, 2012, M52 1,5
- Velhner M., Potkonjak D., Stojanović I., Stojanović D., Petrović J., Kozoderović G.: Salmonella control in poultry production and resistance monitoring in Serbia. Arhiv veterinarske medicine, 4: 11-22, 2011, M52 1,5.
Saradnik na Odeljenju
Marija Dukić
Tehnički saradnik
telefon: 021/4895 347