Одељење за клиничку бактериологију, микологију и паразитологију- Oдељење 130
На Одељењу клиничке бактериологије, микологије и паразитологије запослена су три истраживача у научном звању. Истраживачи учествују у научно истрживачком раду и обављају стручно специјалистичке послове из области здравствене заштите домаћих животиња.
Акредитовано је 6 метода испитивања:
- Испитивање осетљивости ENTEROBACTERIACEAE на антибиотике, методом диск дифузије;
- Утврђивање узрочника салмонелозе (Salmonella spр).
- Утврђивање узрочника варозе пчела (Varroa destructor).
- Одређивање укупног броја аеробних микроорганизама у семену животиња.
- Бактериолошко испитивање фармацеутских производа – провера стерилности.
- Микробиолошка ћистоћа лекова за које се не захтева да буду у складу са тестом на стерилост.
Лабораторијска испитивања обухватају изолацију и идентификацију бактерија, гљивица и плесни, дијагностику екто и ендопаразитоза код животиња. Испитивања се изводе на биолошким материјалима од живих или угинулих домаћих животиња, кућних љубимаца, лабораторијских животиња, пчела и риба. Материјал за испитивања су и назувци, простирка, пелене, брисеви површина (радне површине, брисеви објеката за узгој животиња и транспортних средстава), вода (из вододвода и вода за напајање животиња), пчелиње саће и друго.
На Одељењу се изводе следеће молекуларне методе спитивања:
1 | Изолација DNK (Stoll kit) | Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Lawsonia intracellularis |
2 | Мултиплекс PCR | Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli, Lawsonia intracellularis |
3 | Изолација DNK (Stool Kit) | E. acervulina, E. brunetti, E. maxima, E. mitis, E. necatrix, E. praecox, E. tenella |
4 | Детекција методом PCR | E. acervulina, E. brunetti, E. maxima, E. mitis, E. necatrix, E. praecox, E. tenella |
5 | Изолација DNK (пчеле) | Nosema apis i Nosema ceranae |
6 | Детекција методом PCR (пчеле) | Nosema apis i Nosema ceranae |
7 | Резистотипизaција | Ампицилин, Амоксицилин/ клавулонска киселина, Хлорамфеникол, Ципрофлоксацин, Гентамицин, Налидиксинска киселина, Стрептомицин, Сулфонамиди, Тетрациклин, Триметоприм/сулфаметоксазол, Триметоприм, Цефоподиксим, Цефотаксим, Цефтазидим |
8 | Утврђивање минималне инхибиторне концентрације (MIC) микродилуционом или агардилуционом методом | Ампицилин, Амоксицилин/ клавулонска киселина, Хлорамфеникол, Ципрофлоксацин, Гентамицин, Налидиксинска киселина, Стрептомицин, Сулфонамиди, Тетрациклин, Триметоприм/сулфаметоксазол, Триметоприм, Цефотаксим, Цефтазидим |
9 | Фентипско утврђивање ESBL продукујућих бактерија ( CLSI 2015, документ број М100-С25) | Цефокиситин, Цефепиме, Меропенем |
10 | Утврђивање синергистичке реакције антибиотика са и без клавулонске киселине (потврда ESBL перодукујућих бактерија) | Цефотаксим, Цефтазидим са и без клавулонске киселине |
11 | Утврђивање филогенетске припадности изолата Е. coli PCR методом | Escherichia coli |
12 | Изолација DNK за RAPD методу | Qiagen kit za tkivo |
13 | Утврђивање генетичког диверзитета S. Enteritidis PCR методом | Random amplified polymorphic DNA-RAPD metoda |
14 | Изолација DNKA бактерија | Метода кувања |
15 | Детекција гена који кодирају резистенцију на хлорамфеникол методом PCR | Cat1, cat2, cat3, cmlA, floR |
16 | Детекција гена који кодирају резистенцију на триметоприм методом PCR | drfA1, dfrA5/dfrA14, dfrA7/dfrA17, dfrA12, dfrB1/B2, |
17 | Детекција гена који кодирају резистенцију на стрептомицин методом PCR | strA, strB , aadA1, aadA2 |
18 | Детекција гена који кодирају резистенцију на сулфонамиде методом PCR | sul1, sul2, sul3 |
19 | Детекција гена који кодирају резистенцију на терациклине методом PCR | tetA, tetB, tetC, tetD, tetE, tetG, tetH, tetM, tetO |
20 | Детекција гена који кодирају резистенцију на гентамицин методом PCR | aac(3)-I, aac(3)-II, aac(3)-III, aac(3)-IV, ant(2)-I, armA |
21 | Детекција гена који кодирају резистенцију на проширени спектар бета-лактама методом PCR | blaTEM, blaCTX-M, blaSHV, blaOXA-1, blaOXA-2, blaAmpC, blaCMY |
22 | Детекција гена који кодирају резистенцију на хинолоне која се преноси преко плазмида (PMQR) | qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS, aac61-lb-cr, qepA, oqxA, oqxB |
23 | PCR за умножавање QRDR код салмонелла (пре секвенцирања) | gyrA, gyrB, parC, parE |
24 | PCR за умножавање QRDR код Е.coli (пре секвенцирања) | gyrA, gyrB, parC, parE |
25 | PCR метода за утврђивање мобилних генетичких елемената интегрона и ензима интеграза, детекција гена пре секвенцирања | Int1, int2, 5’3’, Hep74/Hep51 |
26 | Пречишћавање PCR продуката за секвенцирање | Комерцијални кит |
27 | Утврђивање улоге ефлукс пумпе у резистенцији на антибиотике | MIC са циљним антибиотиком и MIC са циљним антибиотиком и ефлукс инхибитором (Phe-Arg-β-Naphtylamide (PAβN) |
28 | Утврђивање појаве коњугабилних плазмида код изолата бактерија | Коњугација са реципијентом E. coli H225 (резистентан на рифапицин) |
29 | Изолација плазмида | Метода по Birnboim/Doly, Алкална лиза |
30 | Поређење нуклотидних и протеинских секвенци | BioEdit и Blast програми |
Референце:
- Velhner M., Kozoderović G., Grego E., Galić N., Stojanov I., Jelesić Z., Kehrenberg C.: Clonal Spread of Salmonella enterica Serovar Infantis in Serbia: Acquisition of Mutations in the Topoisomerase Genes gyrA and parC Leads to Increased Resistance to Fluoroquinolones. Zoonoses and Public Health, ISSN 1863-1959, 60, 8, 1-7, 2013 doi:10-1111/zph 12081, M21 8,0
- Kozoderović G., Velhner M., Jelesić Z., Golić N., Lozo J., Kehrenberg C.: Prevalence of quinolone resistance and mutations in the topoisomerase genes in Salmonella enterica serotype Enteritidis isolates from Serbia. International Journal of Antimicrobial Agents, ISSN 0924-8579, 40, str.455-457, 2012, M21 8,0
- Todorović D., Velhner M., Grego E., Vidanović D., Milanov D., Krnjaić D., Kehrenberg C.: Molecular characterization of multidrug-resistant Escherichia coli isolates from bovine clinical mastitis and oigs in the Vojovodina province Serbia. Microbial Drug Resistance, doi: 10.1089/mdr.2017.0016
- Velhner M: Mechanisms of resistance to quinolones and epidemiological significance of Salmonella Acta Veterinaria, 66:147-159, 2016.
- Kureljušić JM, Dmitirić MP, Vidanović DS, Teodorović VB, Kureljušić BI, Velhner MJ, Karabasil NR: Prevalence of Salmonella enteric in slaughter pigs in Serbia: Serotyping, PFGE-genotyping and antimicrobial resistance. The journal of Infection in Developing Countries, 11:640-645, 2017.
- Milanov D., Ljubojević D., Čabarkapa I., Karabasil N, Velhner M: Biofilm as risk factor for Salmonella contamination in various stages of poultry production. European Poultry Science, DOI: 10.1399/eps.2017.190
- Milanov D., Ljubojević D., Čabarkapa I., Karabasil N, Velhner M: Biofilm as risk factor for Salmonella contamination in various stages of poultry production. European Poultry Science, DOI: 10.1399/eps.2017.190
- Kozoderović G., Velhner M., Jelesić Z., Stojanov I., Petrović T., Stojanović D., Golić N.: Molecular typing and antimicrobial resistance of Salmonella Enteritidis isolated from poultry, food, and humans in Serbia. Folia Microbiologica, ISSN 0015-5632, 56, 3, Str.66-71, 2011, M23 3,0
- Velhner M., Stojanović D.: Mutational Polymorphism in the Bacterial Topoisomerase Genes Driven by Treatment with Quinolones. Point Mutation, Edited by Colin Logie, Rijeka, Intech, 2012, Str.185-210, ISBN 979-953-307-447-3, M14 4,0
- Velhner M., Potkonjak D., Stojanović D., Mitevski D., Stojanov I., Petrović J.: Rezistencija salmonela na antibakterijske lekove i mere kontrole u živinarskoj proizvodnji. Veterinarski glasnik, ISSN 0350-2457, 67, 1-2, str.87-96, 2013, M51 2,0
- Velhner M., Kozederović G., Kovačević M., Suvajdžić L., Košarčić S., Petrović J., Stojanović D.: Resistance to beta lactam antibiotics in gram-negative microorganisms, a brief review. Savremena poljoprivreda, ISSN 0350-1205, 62, 3-4, str., 2013, M51 2,0
- Kozoderović G., Jelesić Z., Velhner M.: Resistance to quinolones among Salmonella enteretidis isolates in Vojvodina. Microbiologia Balkanica 2009, Book of abstracts and Programme, 6th Balkan Congress of Microbiology, Ohrid, 28-31.Oktober, Makedonija, Skopje, Macedonian Medical Association, 2009, Str.120, M34 0,5
- Velhner M., Suvajdžić Lj., Petrović J., Šeperanda M.: Antimicrobial resistance of Escherichia coli in wild animals. Arhiv veterinarske medicine, 5: 35-44, 2012, M52 1,5
- Velhner M., Potkonjak D., Stojanović I., Stojanović D., Petrović J., Kozoderović G.: Salmonella control in poultry production and resistance monitoring in Serbia. Arhiv veterinarske medicine, 4: 11-22, 2011, M52 1,5.
Сарадник на Одељењу
Марија Дукић
Технички сарадник
телефон: 021/4895 347